建筑工程公司入库招标需要准备的材料和程序通常包括以下几点：

初步设计批复或方案批复：如果项目有规划许可证，还需提供规划许可证。

开户银行资金证明：提供原件。

工程施工公开招标核准登记表：需一式三份，从市招标办网站下载。

招标公告：同样需要一式三份。

招标代理合同：如果由代理公司招标，需附上代理人员名单；或者提供自行招标许可证。

基坑围护方案：开挖深度5米以上的工程需要提供。

房屋产权证明和租赁合同：装饰工程需要，未取得房屋产权证明的还需提供原规划许可证、中标通知书、施工许可证、竣工验收报告等。对外立面改变的装饰工程还需提供规划许可证。

资格预审申请报告及资格预审文件：如果招标人对投标申请人进行资格预审，需先提交这些文件，经批准后才能进入报建程序。

此外，还需要准备一些其他相关文件，如企业执照、企业资质证书、税务登记证、组织机构代码证、安全生产许可证、被授权人的身份证、项目经理执业资格证、项目经理职称证（可能还需要安全生产考核合格证）、技术负责人职称证等123。

尽职调查也是招标过程中的重要步骤，需要调查投标单位和参与招标的个人和企业的注册资金、经营项目、投标资格、投标可行性、投标建议等，以确保招标的公正性和有效性4。

投标文件是参与招标的必备材料之一，包括投标函、技术方案、财务方案等内容，需要编写规范以避免投标无效或风险4。

最后，投标报价是招标中的重要组成部分，招标人会根据报价决定是否受理投标单位及择优选择，报价应从总价、工期等方面进行细致说明4。

招标项目中可能还会要求投标单位提供各种担保，如投标保证金、应收账款担保、履约担保等，以确保投标单位的报价符合真实情况，投标文件无欺骗等4。