基础医学专业就业前景很好，待遇也不错，月薪在一万元左右。可以从事医院的临床工作，也可以到相关的医药公司等工作。更可以继续深造，读研读博，到高校当老师教授。
可以转临床医学，只要把基础医学专业课学好了的情况下是可以转临床医学专业学习的，因为基础医学就是临床医学专业的基础课程，包含了生理学，生物化学，人体解剖学，病理学，微生物寄生虫学，免疫学，组织胚胎学，这些都是属于临床医学专业的必修课，学习基础医学专业的学生去学习临床医学专业还比较占据一定的优势。
在基础医学类专业中，生物医学专业和生物医学科学专业的就业前景被认为是非常乐观的。这两个专业的毕业生主要面向学术界、产业界和管理界，就业方向包括科研机构、高等院校、医院、生物医学高新企业以及国家机关等。