论文查重并不仅仅是检查绿色部分，而是检查整篇论文存在的相似度，其中绿色部分只是高亮显示的部分。查重结果是根据比对算法生成的，会给出相似度的百分比或者重复率的数值，根据该数值来判断论文是否存在抄袭等问题。因此，合格的论文需要确保论文整体的相似度控制在一定范围内，而不是仅仅关注绿色部分。
论文查重并不一定必须有绿色部分才能算是合格，因为绿色部分只是表示重复率较低，但并不能保证论文没有抄袭或剽窃的行为。
关键在于被查重的文献是否达到指定的重复率标准，并且，更重要的是，论文的作者必须确保所有的内容都是原创的，并且按照学术规范和道德标准进行写作，以确保学术成果的真实性、可信性和安全性。
因此，绿色部分只是指引性的参考，而不是论文查重的唯一标准。
要进行论文查重，可以使用专业的查重软件或者在线平台。常用的软件包括Turnitin、iThenticate、Copyscape等，也可以通过搜索引擎、文献数据库和科技论文库等渠道进行检索。在进行查重时，需要注意引用的格式和使用的文献引用工具是否正确。同时，还需要注意保护个人作品版权和隐私，以免被滥用或侵犯。