有区别，区别在于，代记账公司和企业会计做账的主要区别体现在以下几个方面：

效率与专业性：代记账公司通常拥有专业的会计团队，人员分工明确，设备齐全，对会计核算和税务处理有丰富的经验，能够快速完成工作任务，提高企业的财务工作效率。相比之下，如果企业选择自行做账，尤其是在交易频繁、产生大量凭证票据的情况下，可能需要投入大量的人力和时间，导致效率低下。

准确性和合法性：代记账公司有专门的负责人员，他们之间可以相互检查，从而确保会计和税务处理的准确性和合法性。而企业自行做账时，由于会计人员的精力有限，对会计账目上的各种数据进行核对和比较可能存在困难，容易导致企业财务和税务数据的错误。

成本考虑：对于许多中小企业来说，特别是在公司成立初期，业务不太频繁，员工人数也不多，选择代理记账可以在一定程度上节省成本。而雇佣专职会计人员则可能带来较高的薪资和其他相关费用。

机密性与责任：代记账公司作为第三方组织，对企业的财务信息具有良好的保密性，减少了企业在这方面的担忧。此外，如果选择代记账公司，可以在合同中明确责任，一旦因记账会计导致财务错误，损失将由记账公司承担，从而降低了企业的风险。

总的来说，代记账公司和企业会计做账在效率、专业性、准确性、成本、机密性和责任等方面存在明显的区别。企业可以根据自身的实际情况和需求，选择适合自己的记账方式。