从综合实力上来讲，东南大学是中央直管，教育部直属的副部级985全国重点大学，又是双一流，合肥工业大学是211工程大学，两所大学的综合实力还是存在一定的差距，东南大学要优于合肥工业大学。
华东师范好。
在第四轮学科评估结果中，软件工程学科评级，它们分别是华东师范大学A，同济大学A-，东南大学B+，而计算机科学与技术学科评级，则是同济大学A-，华东师范大学与东南大学都是B+。
由此可见，华东师范大学和同济大学的软件工程和计算机科学与技术专业都是进入A类的学科，而东南大学则两者都是停留在B+的水平。
这要分所学专业而论。如果是医学类专业，苏大医学部个人认为较好。苏大医学类专业，尤其是在江浙地区内，比较收欢迎，口碑也比较好，理论知识较强。