一、合同性质或编制不同，外包员工属于第三方合同，正式员工事业单位一般都是事业编制。

二、如果没有明确提示待遇参照正式员工的话，那么待遇就要低于正式员工。

三、各种保险的缴纳比例，外包员工的社保类缴纳是由第三方完成，不是由用人单位直接完成，所以很有可能不是按比例缴纳，只会按最低标准缴纳。而正式员工都是由本单位或国家财政负担。

四、出了责任事故，或工伤外包员工一般用人单位不会处理，都是由第三方处理。正式员工则由单位或国家财政承担处理。

五、外包员工的各项福利，除非有明确协议不然是无法和正式员工相提并论的，年终奖、寒暑补贴、节假日等等两者是不相同的。

法律依据：《劳务派遣暂行规定》第三条 用工单位只能在临时性、辅助性或者替代性的工作岗位上使用被派遣劳动者。

前款规定的临时性工作岗位是指存续时间不超过6个月的岗位；辅助性工作岗位是指为主营业务岗位提供服务的非主营业务岗位；替代性工作岗位是指用工单位的劳动者因脱产学习、休假等原因无法工作的一定期间内，可以由其他劳动者替代工作的岗位。

用工单位决定使用被派遣劳动者的辅助性岗位，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定，并在用工单位内公示。